（一）辦公室（黨建科）。負責機關日常運轉，承擔信息、機要、安全、保密、信訪、政務公開、部門信息化和信息共享、新聞宣傳、檔案、接待、政務綜合協調等工作；負責機關財務、資產管理工作和所屬單位財務的監督管理工作；負責內部審計和內管干部經濟責任審計工作；完成上級交辦的其他工作。
（二）資源配置與區域創新科。承擔市科技創新辦公室日常工作；擬訂科技創新發展戰略、規劃并協調實施和開展評估，推進全市科技創新體系建設布局優化；承擔全市科技管理平臺建設工作，協調提出科技資源合理配置的政策措施建議；統籌管理市級科技計劃（專項、基金等），組織制訂市科技計劃項目管理辦法，牽頭制訂年度科技計劃；指導項目管理專業機構建設；負責市級科技創新經費預決算和績效評價；完成上級交辦的其他工作。
（三）高新技術產業科。擬訂高新技術發展及其產業化的規劃和政策，組織開展相關領域技術發展需求分析；指導高新技術特色產業基地、省級科技產業園建設；編制和組織實施市重點產業技術創新計劃，推動關鍵核心技術攻關；負責國家、省、蘇州市高新技術領域的重點研發計劃等項目組織推薦工作；培育和推動高成長創新型企業、瞪羚企業、高新技術企業、科技小巨人企業、科技型上市企業等發展，構建創新型企業梯隊；完成上級交辦的其他工作。
（四）科技成果轉化與應用科（農村科技科）。擬訂促進科技成果轉化及產業技術創新、科技知識產權創新、科技服務業、科技促進農業、農村的政策措施；指導科技服務業集聚區、科技企業孵化器（眾創空間、星創天地）等建設，組織申報和實施省科技型創新企業孵育計劃；承擔全市技術轉移體系工作，推進研發資源開放共享，推動科技服務業、技術市場和科技中介組織發展，負責技術合同認定登記工作。指導新型研發機構、外資研發機構、重點實驗室、工程技術研究中心、公共技術服務平臺、企業院士工作站等科技基礎設施建設；承辦實驗動物管理工作；推動農業、農村科技進步和農業科技創新服務體系建設；指導常熟國家農業科技園區和省、市級農業科技示范園區工作；完成上級交辦的其他工作。
（五）科技人才與合作科（引進國外智力辦公室）。擬訂促進產學研融合發展、科技金融結合、國際科技合作交流及創新能力開放合作、引進國外智力和外國專家的政策措施并推動落實；組織推薦和申報國家、省、蘇州市國際科技合作、科技人才、科技金融（風險補償專項資金）等科技計劃，編制和組織實施市級國際科技合作、產學研合作、科技金融等科技計劃；做好科技鎮長團的溝通協調和管理服務，促進產學研深度融合；負責區域科技合作與交流，推進長三角科技合作發展，綜合協調G60科創長廊工作；負責科技對口支援工作；指導國際合作基地建設；承擔外國人來我市工作、外國高端人才資質管理和服務保障；完成上級交辦的其他工作。
