辦公室：負責機關日常運轉工作；承擔文電、會務、機要、檔案、督查、重要文稿起草、保密、信訪、政務公開、綜合治理、人武和雙擁、建議提案辦理等工作；承擔衛生健康宣傳、精神文明建設、意識形態管理、衛生健康系統新聞和信息發布、網絡輿情應對處置工作；負責衛生健康系統作風效能建設；完成上級交辦的其他工作。
人事科教科：負責機關和所屬單位的干部人事管理和機構編制工作；擬訂全市衛生健康人才發展政策、規劃并組織實施；指導全市衛生健康人才隊伍建設；指導所屬單位離退休人員管理；擬訂所屬事業單位績效評價和考核辦法并組織實施；會同有關部門組織實施各類衛生健康專業技術人員資格標準；組織指導衛生健康管理干部培訓工作；組織指導衛生健康工作領域的對外交流與合作、援外工作；承擔機關和所屬單位外事管理工作；擬訂衛生健康科技發展規劃及相關政策；組織指導衛生健康科技創新與成果轉移轉化體系建設；組織實施衛生健康科研項目、新技術評估管理和適宜技術推廣；組織開展住院醫師、?？漆t師培訓等畢業后醫學教育和繼續醫學教育工作；完成上級交辦的其他工作。
財務審計科：擬訂全市衛生健康經濟政策；承擔機關和預算管理單位預決算、財務、資產管理、政府采購和內部審計工作；提出各類衛生健康專項資金安排建議并監督使用；負責市級衛生總費用核算工作；提出全市醫療服務價格政策建議；組織實施大型醫用裝備配置管理，負責全市醫療機構設備采購的日常監管；完成上級交辦的其他工作。
政策法規和綜合監督科：負責衛生健康法律法規政策的組織實施；承擔規范性文件的合法性審查工作，承擔行政復議、行政應訴等工作；根據法律法規、國家和省有關文件以及江蘇省部門行政權力清單，負責本部門行政審批事項的有關工作；負責推進衛生健康法制建設；承擔公共衛生、醫療衛生等監督工作，查處醫療服務市場違法行為；組織開展職業衛生、放射衛生、學校衛生、公共場所衛生、飲用水衛生、傳染病防治和健康產業等監督檢查工作；完善綜合監督體系，指導規范執法行為；推進全市衛生健康誠信體系建設；完成上級交辦的其他工作。
醫政醫管科（基層衛生科）：監督實施國家醫療機構及醫務人員、醫療技術應用、醫療質量和安全、醫療服務、采供血機構管理以及行風建設等行業管理政策規范、標準；貫徹落實醫療技術、醫療質量、醫療服務等法規規范，擬訂相關政策措施并組織實施；承擔推進護理、康復等事業發展工作；統籌規劃和督導落實醫共體各成員單位運行管理、功能定位、全科?？瓢l展、資源整合、健康管理特色等工作；指導全市基層衛生健康服務體系建設和基層醫療衛生機構能力評價工作，指導家庭醫生簽約服務和鄉村醫生相關管理工作；牽頭推進長三角“一體化”衛生健康相關工作；承擔市平安醫院創建綜合協調和指導工作；指導實施國內對口支醫工作；貫徹落實國家藥物政策和國家基本藥物制度，執行國家基本藥物目錄，擬訂全市基本藥物配備使用的政策措施；指導醫療機構藥學服務工作，組織開展藥品使用監測、臨床綜合評價和短缺藥品監測預警，協調制訂短缺藥品供應保障措施；負責保健對象的醫療保健工作，負責市級部門有關干部醫療管理工作，指導全市健康管理工作；完成上級交辦的其他工作。
中醫藥管理科：貫徹國家中醫藥工作方針政策，擬訂中醫藥事業中長期發展規劃、計劃并組織實施；促進虞山醫派傳承與發展；指導并監督中醫醫療機構及其醫務人員、醫療質量、醫療服務等管理政策規范、標準實施；指導醫療衛生機構中醫藥工作；負責上級中醫藥部門下達的中醫藥師承教育、畢業后教育、繼續教育和相關人才培訓工作；完成上級交辦的其他工作。
疾病預防控制和健康促進科（職業健康科）：擬訂全市重大疾病防治規劃、免疫規劃、嚴重危害人民健康的公共衛生問題的干預措施并組織實施，完善疾病預防控制體系，防止和控制疾病的發生和疫情的蔓延；承擔傳染病疫情信息的報告工作；貫徹落實食品安全地方標準，開展食品安全風險監測、評估和交流；擬訂醫養結合政策措施，承擔老年疾病防治、老年人醫療照護、老年人心理健康與關懷服務等老年健康工作；組織實施職業衛生相關政策，貫徹落實職業衛生地方標準；組織開展職業衛生監督管理工作；開展重點職業病監測、專項調查、職業健康風險評估和職業人群健康管理工作；承擔職業病防治工作；負責擬訂健康常熟建設職責分工方案、年度計劃和相關制度，并協調組織實施；組織開展健康教育、健康促進活動；組織對全市各板塊、各部門推進健康常熟建設工作的指導與督查評價工作；負責深入開展愛國衛生工作，組織開展衛生城鎮（村）、健康城鎮、健康場所等各級各類衛生健康建設鞏固和評價工作；完成上級交辦的其他工作。
婦幼健康和家庭發展科：擬訂全市婦幼衛生健康政策并組織實施；推進婦幼健康服務體系建設；監督指導婦幼衛生、母嬰健康安全保障、出生缺陷防治、嬰幼兒早期發展和生育技術服務工作；規范人類輔助生殖技術和避孕藥具管理；貫徹落實生育政策，承擔全市出生人口監測工作，提出人口與家庭發展相關政策建議，組織實施國家和省計劃生育特殊家庭扶助制度；完成上級交辦的其他工作。
規劃信息科（數據管理科）：組織擬訂衛生健康事業發展中長期規劃，統籌規劃與協調優化全市醫療衛生資源配置工作；指導全市衛生健康事業發展規劃的編制與實施；指導衛生健康服務體系建設；組織與指導衛生健康信息化建設，加強部門信息化管理，按照上級要求落實信息共享工作；組織開展衛生健康統計工作；統籌本部門、本行業數據管理工作，負責政務數據資源管理，組織協調數字政府項目建設推進及運行保障；完成上級交辦的其他工作。
衛生應急和安全生產監督管理科（后勤管理科）：承擔突發公共衛生事件的預防控制和緊急醫學救援工作；組織編制專項預案，承擔預案演練的組織實施和指導監督工作；指導衛生應急體系和能力建設；統籌協調本部門、行業安全生產監管工作；貫徹執行安全生產法律法規；指導監督醫療衛生機構及其他下屬單位落實安全生產主體責任和重大危險源管理責任；組織開展安全生產宣傳、教育、培訓工作；組織實施安全生產日常檢查和專項整治工作；承擔突發公共衛生事件應急處置信息和安全生產事故信息的報告工作，開展相關統計分析；依法組織、參與、配合防臺防汛、安全生產事故應急救援、善后處置和調查處理；做好各類次生、衍生事故的防范工作，負責安全生產等各類事故醫療衛生救援工作；承擔重要會議與重大活動的醫療保障工作；指導全市衛生健康行業落實治安保衛、消防安全和后勤管理工作；協調全市衛生健康領域基本建設，指導所屬單位基本建設；完成上級交辦的其他工作。
